Este patrocinio está regido por dos principios: independencia y transparencia.

El principio de independencia se refiere a que el abordaje de los temas de eviDoctor se realiza por un carril distinto a los eventuales patrocinadores. Por ejemplo, si el tema es hipertensión arterial, qué antihipertensivos se recomiendan no depende de los patrocinadores comerciales y sus productos, sino de la evidencia existente para recomendarlos. Es así que, en este caso, los diuréticos tiazídicos son de primera línea por su efectividad y bajo costo. Este principio también se aplica a las opiniones de participantes y expertos: por ejemplo, en la acupuntura para la lumbalgia se revisó la evidencia, más allá de la opinión experta.